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本文介紹兩種基本氨基酸:甘氨酸(Gly)和丙氨酸(Ala)。這主要是因為它們可以作為打底氨基酸,給它們添加基團可以生成其他種類的氨基酸。
甘氨酸有一種特殊的甜味,所以它的英文名字來自希臘語glykys(甘甜)。甘氨酸的漢譯不僅有“甜”的意思,而且發音相近,堪稱“信、達、雅”的典范。由于甘氨酸的甜味,在食品工業中常被用作調味劑,以去除苦味,增加甜味。甘氨酸的側鏈很小,只有一個氫原子。這讓他與眾不同。它是一種沒有手性的堿性氨基酸。
甘氨酸在蛋白質中的特點是體積小、靈活。例如,膠原蛋白的三股螺旋構象就非常特殊。每兩個殘基必須有一個甘氨酸,否則會導致空間位阻過大。同樣,一個蛋白質的兩個結構域之間的連接通常需要甘氨酸提供構象靈活性。然而,如果甘氨酸足夠靈活,其穩定性必然不足。
在α-螺旋的形成過程中,甘氨酸是擾流劑之一。原因是側鏈太小,構象根本不能穩定。此外,甘氨酸常用于制備緩沖溶液。經常做電泳實驗的人一定記得。
丙氨酸的英文名字來自德語乙醛,中文名字比較容易理解,因為丙氨酸含有三個碳,化學名稱是氨基丙酸。這是一個簡單的名字,就像氨基酸的特征一樣。丙氨酸的側鏈只有一個甲基,比甘氨酸略大。當我畫出其他18種氨基酸的結構公式時,我給丙氨酸加基團。在蛋白質中,丙氨酸就像一塊磚,是一種普通的基本建筑材料,與任何人都不沖突。
丙氨酸側鏈位阻小,位于α-螺旋中,是一種構象;β-折疊時也非常穩定。在蛋白質工程中,如果想要突變蛋白質上沒有特定靶點的某個氨基酸,一般可以將其突變為丙氨酸,不容易破壞蛋白質的整體構象。
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